Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CARMIL1Q5VZK9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms