Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHEQ5VZ18 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHEQ5VZ18 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms