Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRIP1Q5VSL9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms