Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CC2D1BQ5T0F9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms