Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FFAR4Q5NUL3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FFAR4Q5NUL3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms