Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms