Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP78Q5JTW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms