Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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