Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ODF2Q5BJF6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms