Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms