Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL12Q53G59 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms