Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4orf17Q53FE4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4orf17Q53FE4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms