Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE2Q495Y8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE2Q495Y8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms