Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HFEQ30201 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HFEQ30201 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms