Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VWC2Q2TAL6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms