Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPHKAPQ2M3C7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPHKAPQ2M3C7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms