Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GEN1Q17RS7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GEN1Q17RS7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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