Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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