Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HADHQ16836 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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