Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN1Q16658 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN1Q16658 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN1Q16658 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN1Q16658 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN1Q16658 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms