Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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GRIK4Q16099 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GRIK4Q16099 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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GRIK4Q16099 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK4Q16099 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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