Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1EQ15878 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms