Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GRK1Q15835 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms