Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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