Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALX1Q15699 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALX1Q15699 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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