Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TAF13Q15543 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms