Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRKQ15262 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRKQ15262 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
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