Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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