Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms