Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAM2Q15035 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms