Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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