Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NCAPHQ15003 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NCAPHQ15003 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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