Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMC1AQ14683 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMC1AQ14683 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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