Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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