Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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GBX1Q14549 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GBX1Q14549 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GBX1Q14549 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GBX1Q14549 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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