Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SCARB2Q14108 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARB2Q14108 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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