Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms