Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A3Q14050 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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