Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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