Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1SQ13698 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1SQ13698 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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