Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PMS2P11Q13670 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PMS2P11Q13670 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PMS2P11Q13670 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PMS2P11Q13670 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PMS2P11Q13670 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PMS2P11Q13670 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PMS2P11Q13670 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PMS2P11Q13670 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PMS2P11Q13670 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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