Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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