Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX6Q13608 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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