Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2DQ13557 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms