Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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