Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLF1Q13351 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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