Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP140Q13342 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP140Q13342 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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