Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CALCOCO2Q13137 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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CALCOCO2Q13137 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CALCOCO2Q13137 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CALCOCO2Q13137 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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