Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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