Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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NPRL3Q12980 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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NPRL3Q12980 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPRL3Q12980 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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